Katedra Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt
Wydział Medycyny Weterynaryjnej i Nauk o Zwierzętach
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu
Projekty badawcze finansowane ze źródeł zewnętrznych
aktualnie realizowane projekty
- Grant NCN-OPUS „Wyjaśnienie molekularnego podłoża zaburzeń rozwoju płci psów przy pomocy kompleksowej analizy transkryptomu i epigenomu gonad”Kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński, czł. rzecz. PAN, dr h.c.nr 2023/51/B/NZ9/01165okres realizacji: 21.06.2024 do 20.06.2027Nr UPP: 11/2024/OPUSBudżet: 2 522 960Elucidating the molecular background of disorders of sex development in dogs by comprehensive analysis of gonadal transcriptome and epigenome
- Projekt NCN Opus Poznawanie podłoża molekularnego zmienności antygenów erytrocytarnych koni z wykorzystaniem metod serologicznych i genetycznych
kierownik: dr hab. Jakub Cieślak
nr 2022/47/B/NZ9/02331
okres realizacji: 2023-2026 - Grant NCN OPUS “Rola mitochondriów w kształtowaniu rozwoju zarodków ssaków, od zapłodnienia do pierwszych sygnałów indukujących różnicowanie komórek”.
Kierownik projektu dr hab. Zofia Madeja
nr 2022/47/B/NZ3/02697
okres realizacji: 02.10.2023 do 02.10.2027 - NCN OPUS21: Wpływ suplementacji kwasami z rodziny n-3 na metabolizm lipidów w blastocystach bydła pozyskanych in vivo i in vitro
Nr 2021/41/B/NZ9/01256
kierownik projektu prof. Dorota Cieślak
27.12.2021-26.12.2025
Nr UPP 30/2021/OPUS
Budżet: 1 669 620zł
Effect of n-3 FA supplementation on lipid metabolism in bovine blastocysts produced in vivo and in vitro - NCN: Dodatek pieprzycy peruwiańskiej (Lepidium meyenii) w żywieniu świń i jej wpływ na gospodarkę lipidową – badanie nutrigenomiczne
Nr 2020/39/O/NZ9/00816,
kierownik projektu dr hab. Joanna Nowacka – Woszuk
01.10.2021 – 30.09.2025
Nr UPP 8/2021/PRELUDIUM BIS
Budżet: 541 360,00 zł
The addition of Peruvian maca (Lepidium meyenii) in pig nutrition and its effect on lipid metabolism – a nutrigenomic study - NCN: Wykorzystanie analizy transkryptomicznej do identyfikacji genów związanych z występowaniem przepuklin pępkowych świń
Nr 2019/33/B/NZ9/00654,
kierownik projektu dr hab. Joanna Nowacka – Woszuk
24.02.2020 – 23.02.2023
Nr UPP 3/2020/OPUS
Budżet: 1 048 080,00 zł
The application of transcriptome profiling to identify genes associated with umbilical hernia in pigs - NCN: Zastosowanie technologii CRISPR-Cas9 do wyjaśnienia czy zmiany architektury jądra interfazowego w trakcie adipogenezy są przyczyną czy skutkiem aktywności transkrypcyjnej genów
Nr 2018/29/B/NZ2/00956,
kierownik projektu prof. dr hab. Izabela Szczerbal
31.01.2019 – 30.01.2023
Nr UPP 16/2019/OPUS
Budżet: 1 469 700,00 złThe application of CRISPR-Cas9 technology to elucidate whether changes in nuclear architecture during adipogenesis are a cause or a consequence
Projekty Zakończone w latach 2021 - 2022
- NCN: Znaczenie białek i otoczki jądrowej (laminy A/C oraz receptora laminy B) dla położenia genów w trójwymiarowej przestrzeni jądra interfazowego podczas adipogenezy in vitro
Nr 2020/04/X/NZ2/00182,
kierownik projektu: dr Joanna Długosz
16.10.2020 – 15.10.2021
Nr UPP: 21/2020/MINIATURA
Budżet: 49 995,00 zł
The importance of nuclear lamins (lamin A/C and laminB receptor) for the threedimensional positioning of genes in interphase nuclei during in vitro adipogenesis - NCN: Identyfikacja markerów genetycznych i epigenetycznych związanych z wnętrostwem psów
Nr 2018/29/B/NZ9/01065,
kierownik projektu prof. dr hab. Marek Świtoński
24.01.2019 – 23.07.2022
Nr UPP 13/2019/OPUS
Budżet 1 154 210,00 zł - NCN: Identyfikacja genetycznych mechanizmów kontrolujących zmienność fenotypową wielkości miotu świń.
Nr 2016/23/D/NZ9/00029,
kierownik projektu dr inż. Ewa Sell-Kubiak
10.08.2017 – 9.08.2021
Nr UPP 21/2017/SONATA
Budżet: 700 071,00 zł
Identifying genetic mechanisms regulating phenotypic variability of litter size in pigs - NCN: Identyfikacja markerów otyłości psów przy pomocy sekwencjonowania całogenomowego
Nr 2016/23/B/NZ2/01762,
kierownik projektu prof. dr hab. Maciej Szydłowski.
4.08.2017 – 3.08.2021
Nr UPP 16/2017/OPUS
Budżet: 1 132 100,00 zł
Identyfication of obesity risk variants in the dog genome using whole-genome sequencing. - NCN: Udział kwasu arachidonowego w kształtowaniu jakości oocytów świni domowej
Nr 2016/23/N/NZ9/02155,
kierownik projektu mgr Natalia Małyszka
28.07.2017 – 27.07.2022
Nr UPP 19/2017/PRELUDIUM
Budżet: 144 480,00 zł
Involvement of the arachidonic acid in shaping the quality of oocytes of the domestic pig. - NCN: Metabolizm kwasów tłuszczowych i glukozy podczas dojrzewania in vitro oocytów bydła i jego wpływ na jakość oocytów oraz zarodków pochodzących z zapłodnienia in vitro.
Nr 2017/27/B/NZ9/00904,
kierownik projektu dr hab. Ewelina Warzych-Plejer
24.07.2018 – 23.07.2021
Nr UPP 18/2018/OPUS
Budżet 936 800,00 zł
The metabolism of fatty acids and glucose during in vitro maturation of bovine oocytes and its influence on the quality of oocytes and in vitro derived embryos - NCN: Kompleksowa charakterystyka regionów kandydujących w genomie psa dla monogenowych zaburzeń rozwoju płci, oparta o sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) i cyfrowy emulsyjny PCR (ddPCR)
Nr 2016/23/B/NZ9/03424,
kierownik projektu prof. dr hab. Marek Świtoński.
18.07.2017 – 17.07.2021
Nr UPP 15/2017/OPUS
Budżet: 993 500,00 zł
A comprehensive characteristics of candidate genomic regions for canine monogenic disorders of sex development, analyzed with the use of next generation sequencing (NGS) and droplet digital PCR (ddPCR) - NCN: Identyfikacja molekularnych zjawisk przyczynowych związanych z wczesnym rozwojem raka jelita grubego u genetycznie zmodyfikowanych świń w locus APC,
Nr 2016/21/D/NZ2/03830,
kierownik projektu dr Monika Dragan,
8.02.2017r. – 7.02.2022r.
Numer w UPP 4/2017/SONATA
Budżet: 1 024 386,00 zł
Identifying molecular events for transformation of early colorectal polyps. Studies with APC1311-targeted pigs.
projekty zakończone w latach 2016-2020
- NCN: Poszukiwanie genetycznego podłoża zmienności cech o złożonym uwarunkowaniu u koni z wykorzystaniem nowoczesnych metod genomiki strukturalnej i funkcjonalnej. Charakterystyka genomiczna składu mleka klaczy należących do wybranych ras koni,
nr 2011/03/D/NZ9/05337,
kierownik projektu: dr Jakub Cieślak,
16.08.2012 do 15.08.2017
Searching for the genetic background of horse complex traits variability with the application of modern structural and functional genomics methods. Genomic characteristics of mares milk compostion for selected horse breeds.
- NCN: Poszukiwanie podłoża dziedzicznego zespołu odwróconej płci psów z kariotypem 78,XX ,
nr 2012/05/B/NZ9/00907,
kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński,
22.02.2013 – 21.02.2016
Searching for the background of the canine sex reversal syndrome (78,XX disorder of sexual development)
8/2013/OPUS
- NCN: Wpływ inhibitorów ścieżek różnicowania komórkowego na rozwój i jakość blastocyst bydła in vitro,
nr 2012/05/B/NZ9/03349,
Kierownik projektu: Prof. dr hab. Dorota Cieślak,
25.03.2013 – 24.03.2017
The influence of metabolic pathway inhibitors on the development and quality of bovine embryos produced in vitro.
10/2013/OPUS
- NCN: Epigenetyczne mechanizmy kontroli ekspresji genów zaangażowanych w odkładanie tkanki tłuszczowej świni domowej, nr 2012/07/E/NZ9/02573,
kierownik projektu: dr hab. Izabela Maria Szczerbal,
08.07.2013 – 07.12.2018
Epigenetic mechanisms controlling expression of genes involved in fat tissue accumulation in pigs.
20/2013/SONATA BIS
- NCN: Wpływ diety ciężarnych samic szczura na dziedziczenie wzorów metylacji DNA potomstwa,
nr 2013/09/D/NZ2/02006,
kierownik projektu: dr inż. Joanna Nowacka – Woszuk,
14.03.2014 – 13.03.2018,
Budżet: 694 145,00 zł
The effects of pregnant female diet on the DNA methylation patterns inheritance in theoffspring.
7/2014/SONATA
- NCN: Poszukiwanie markerów genetycznych i epigenetycznych zwiazanych z predyspozycją psów do rozwoju otyłości,
nr 2013/09/B/NZ2/02208,
kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński,
11.03.2014 – 10.03.2017,
Searching for genetic and epigenetic markers associated with predisposition to obesity in the dog.
Budżet: 799 500,00 zł
6/2014/OPUS
- NCN: Genetyczne i środowiskowe uwarunkowania zmienności emisji metanu uwalnianego przez krowy mleczne,
nr 2013/09/B/NZ9/03179,
kierownik projektu: dr hab. Tomasz Strabel,
24.02.2014 – 23.02.2017,
Budżet: 890 578,00 zł
Genetic and phenotypic contribution to variability of methane emitted by dairy cows.
3/2014/OPUS
- NCN: Zintegrowana analiza genomiczno-epigenomiczna świni domowej jako modelu dla dziedzicznych nowotworów jelita grubego człowieka,
nr 2013/10/M/NZ2/00284,
kierownik projektu: Prof. dr hab. czł. koresp. PAN Marek Zbigniew Świtoński,
06.06.2014 – 05.06.2017,
Budżet: 1 254 240,00 zł
505.004.10 HARMONIA
Comprehensive transcriptomic and epigenomic analysis of the genetically-defined pigs predisposed to colorectal cancer.
- NCN: Transkryptom oocytów i blastomerów przedimplantacyjnych zarodków świni w kontekście procesu starzenia,
nr 2014/13/D/NZ2/03901,
kierownik projektu: dr inż. Piotr Pawlak,
18.02.2015 – 17.02. 2018,
Single cell RNA-Seq profiling during preimplantation porcine embryo development in relation to oocyte aging
Budżet: 1 233 198,00 zł
3/2015/SONATA
- MNiSW: Poszukiwanie mutacji warunkującej rozjaśnienie bułane umaszczenia konia domowego, nr 0068/IP1/2015/73;
kierownik projektu: dr Jakub Cieślak,
wykonawcy: dr Mariusz Maćkowski,
23.02.2015 – 22.02.2017,
Budżet: 299 920,00 zł
Screeninng for the mutation causing equine dun coat color dilution.
6/2015/IUVENTUS
- VII Program Ramowy UE: Kompleksowe podejście do optymalizacji wydajności wykorzystania paszy i ograniczenia negatywnego wpływu na środowisko chowu zwierząt monogastrycznych
(ECO-FCE). KBBE. 2012.1.3.-03. Nr kontraktu: 311794,
kierownik (poznańskiej części) projektu: prof. dr hab. Tomasz Szwaczkowski,
1.02.2013 – 31.01.2017.
Monogastrics Feed Efficiency – Efficiency of terrestrial livestock digestive systems and reduction of the ecological footprint through a combination of systems biology, ’omics’ and nutrition .
- NCN: Poszukiwanie polimorfizmów w częściach strukturalnych genów LGB1, LGB2, LALBA konia domowego i ich związek z poziomem ekspresji genów,
nr 2016/21/N/NZ9/01350;
kierownik projektu mgr inż. Łukasz Wodas,
3.02.2017 – 2.02.2020
Nr UPP 5/2017/PRELUDIUM
Budżet: 142 200,00 zł
Search for polymorphisms in the structural regions of the LGB1, LGB2 and LALBA genes of the domestic horse and their association with expression level.
- NCN: Parametryczna klasyfikacja jakościowa oocytów oraz zarodków zwierząt z wykorzystaniem techniki lab-on-a-chip oraz metod detekcji spektro- i fluorymetrycznych.
Nr 2013/08/S/ST7/00575,
kierownik projektu dr inż. Patrycja Śniadek
1.10.2013 – 6.08.2019
Nr UPP 22/2013/FUGA
Budżet: 366 000,00 zł
- NCN: Mitochondria jako kluczowy parametr w ocenie jakości plemników buhajów
Nr 2018/02/X/NZ9/02949,
kierownik projektu dr inż. Zofia Madeja
30.03.2019 – 12.09.2020
Numer w UPP 24/2019/MINIATURA
Budżet: 49 005,00 zł
projekty zakończone w latach 2010-2015
- „ Ekspresja i polimorfizm genów kodujących białka zaangażowane w metabolizm kwasów tłuszczowych świni”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński
Budżet: 391 900,00 zł
14.05.2009 – 13.05.2012
nr 2889/B/P01/2009/36
Numer w UPP 13/2009/GW
- „Polimorfizm i poziom transkrypcji genów kandydujących ADIPOQ i RENT dla cech otłuszczenia świni domowej”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński
budżet: 73 100,00 zł
Realizacja: 22.09.2009 – 31.12.2010
nr 0692/B/P01/2009/37
Numer w UPP nr 36/2009/GP
- „ Genetyczne aspekty zmienności cech i możliwości ich wykorzystania w selekcji kur nieśnych ukierunkowanej na ujednolicenie produktu.”
Kierownik projektu: dr inż. Anna Wolc
Budżet: 43 880,00 zł
09.10.2009 – 08.01.2011
nr 0792/B/P01/2009/37
Numer w UPP nr 40/2009/GW
- „Dojrzałość płciowa a jakość oocytów pozyskanych od młodych loszek rzeźnych” realizowanego w ramach Akcji COST FA0702
Kierownik projektu: prof. dr hab. Dorota Cieślak,
5.05.2009 – 04.05.2012
nr 451/N-COST/2009/0
Numer w UPP nr 505.012COST
- „Charakterystyka markerów pluripotencji bydła – poszukiwanie optymalnych warunków do wyprowadzenia embrionalnych linii komórek macierzystych bydła”
Fundacja na Rzecz Nauki Polskiej – Homing Nr HOM/2009/6B
Kierownik projektu: dr inż. Zofia Madeja
Budżet: 92 000,00 zł
19.10.20010 – 30.09.2011
Nr HOM/2009/6B
- „Metabolity płynu pęcherzykowego oraz poziom apoptozy i ekspresja wybranych genów w komórkach pęcherzykowych jako parametry oceny kompetencji rozwojowej oocytów i zarodków bydła”
Kierownik projektu: dr hab. Ewelina Warzych-Plejer
Budżet: 372 250,00 zł
19.03.2010-18.03.2013
nr 6044/B/P01/2010/38
Nr UPP nr 9/2010/GW
- “Mapowanie QTL kaczki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Tomasz Szwaczkowski
Budżet: 284 062,00 zł
13.04.2010 – 12.04.2013
nr 2398/B/PO1/2010/38
Nr UPP nr 38/2010/GW
- “Znaczenie mikroRNA (miRNA) w kontroli ekspresji genów kandydujących dla cech otłuszczenia świni.”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński
Budżet: 293 500,00 zł
22.10.2010 – 21.10.2013
nr 0290/B/P01/2010/39
Nr UPP 64/2010/GW
- “Poziom inbredu osobniczego i matczynego oraz jego wpływ na wybrane cechy użytkowe owiec”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Tomasz Szwaczkowski, prof. zw.
Budżet: 38 617,00 zł
22.10.2010 – 21.10.2011
nr 0288/B/P01/2010/39
Nr UPP 63/2010/GP
- „Epigenetyczne mechanizmy regulujące ekspresję genów w preadipocytach i adipocytach świni domowej – poszukiwania markerów wpływających na odkładanie tkanki tłuszczowej”.
Kierownik projektu: dr inż. Izabela Szczerbal
Przyznana kwota: 95 000,00 zł.
Realizacja: 22.12.2010 – 31.12.2011
Numer 0406/P01/2010/70
Numer w UPP 90/2010/Iuventus
- „Ekspresja markerów pluripotencji oraz stabilność genomowa pierwotnych komórek zarodkowych bydła”
Kierownik projektu: dr inż. Zofia Eliza Madeja
Przyznana kwota: 388 000,00
Realizacja: 30.09.2010 do 29.09.2013
Nr 4429/B/P01/2010/39
Numer w UPP nr 59/2010/GW
- „Polimorfizm genów zaangażowanych w kształtowanie cech pokroju koni”
Kierownik projektu: dr Mariusz Maćkowski
Przyznana kwota: 196 300,00
Realizacja: 19.03.2010 do 18.03.2013
Umowa nr: 2414/B/P01/2010/38
Numer w UPP nr:8/2010/GW
- „Wpływ informacji markerowej na wzrost dokładność szacowania addytywnych efektów genetycznych”
Kierownik projektu: mgr, inż. Marcin Pszczoła
Realizacja: 13.12.2011 do 12.12.2012
Umowa nr UMO-2011/01/N/NZ9/00614
Numer UPP nr 69/2011/GBD
- „Wielkośc adipocytów i zmienność ekspresji genów zaangażowanych w powstawanie i morfologię kroplii lipidowych jako marker otłuszczenia świni”
Kierownik projektu: mgr inż. Beata Kociucka
Przyznana kwota: 214 200,00
Realizacja: 12.12.2011 do 11.12.2014
Numer 2011/01/N/NZ9/01667
Numer w UPP nr 67/2011/GBD
- „Architektura jąder interfazowych blastomerów przedimplantacyjnych zarodków bydła z uwzględnieniem chromosomów mieszczących loci genów istotnych dla procesu różnicowania”
Kierownik projektu mgr Maciej Orsztynowicz
Przyznana kwota 170 300,00
Realizacja od 12.12.2011 do 11.12.2014
Numer 2011/01/N/NZ9/00792
Numer w UPP nr 68/2011/GBD
Projekty zakończone w latach 2005-2009
- KBN: „Apoptoza spermatocytów jako efekt nietypowego przebiegu mejotycznej koniugacji chromosomów – zachowanie się chromosomów B u lisa pospolitego i jenota chińskiego podczas mejozy”
umowa nr 0964/P06/2005/29
realizacja 31.10.2005 – 30.10.2008
kierownik projektu: dr Jarosław Sosnowski
przyznana kwota: 199 000,00 zł. - KBN: „Profil ekspresji genów, istotnych dla gospodarki lipidami, w mięśniach świń oraz ich związek z cechami mięsa”
realizacja: 14.11.2005 – 31.10.2008
kierownik zadania: prof. dr hab. Marek Świtoński
przyznana kwota: 300 000,00 zł. - KBN: „Szacowanie poziomu inbredu i depresji inbredowej cech produkcyjnych bydła rasy polskiej holsztyńsko-fryzyjskiej.”
umowa nr 0766/P01/2006/30
realizacja: 19.04.2006 – 18.10.2007
kierownik projektu: dr Tomasz Strabel
przyznana kwota: 72 812,00 zł. - KBN: „Analiza porównawcza wybranych genów determinacji płci czterech gatunków z rodziny psowatych”
umowa nr PB 3332/P01/2006/31
realizacja: 04.10.2006 – 03.04.2008
kierownik projektu: prof. dr hab. Marek Świtoński
przyznana kwota: 43 000,00 zł. - KBN: „Czas zachodzenia pierwszego podziału w zygotach bydlęcych in vitro. Związek z obecnością hormonu wzrostu podczas dojrzewania oocytów oraz możliwość wykorzystania w selekcji zarodków o dobrej jakości”
umowa nr 3780/P01/2006/31
realizacja: 17.10.2006 – 16.10.2009
kierownik projektu: dr hab. Dorota Cieślak
przyznana kwota: 290 000,00 zł. - MNiSW: ”Architektura jądra interfazowego w trakcie różnicowania komórek tłuszczowych świni domowej (Sus scrofa domestica L.) i jej związek z ekspresją wybranych genów zaangażowanych w adipogenezę”
Umowa nr 3381/B/P01/2007/33
Realizacja: 30.11.2007 – 29.11.2010
Kierownik projektu: dr Izabela Szczerbal
Przyznana kwota: 201 000,00 zł.